Nell'annata 2016/17 il difensore si trasferisce al Clermont Foot, Club sempre appartenente alla seconda divisione francese. Nella città di Clermont-Ferrand, Centonze disputa due stagioni nelle quali colleziona 66 presenze totali, nelle quali mette a referto anche una rete e cinque assist.
Nella stagione 2018/19 passa al Lens in Ligue 2, Club con cui gioca 40 partite in totali nelle quali serve quattro assist. L'anno successivo Centonze si trasferisce al Metz e fa il suo esordio in Ligue 1 l'11 agosto 2019, nella sfida terminata 1-1 contro lo Strasburgo. Il difensore disputa tre stagioni totali con la maglia del Metz, squadra con cui disputa 91 partite realizzando sei reti e quattro assist in totale.
Centonze si trasferisce a ottobre 2022 al Nantes, nella massima serie francese, Club con cui fa il suo esordio il 23 ottobre nel match di campionato contro il Nizza pareggiato per 1-1. Il 16 febbraio 2023 il difensore fa il suo debutto in Europa in un match di UEFA Europa League contro la Juventus, sfida terminata anch'essa con il risultato di 1-1. In totale con la maglia del Nantes Centonze ha collezionato 35 presenze nelle quali ha servito due assist.
Hellas Verona FC rivolge un caloroso saluto a Fabien, augurandogli un futuro in maglia gialloblù ricco di soddisfazioni, personali e di squadra".
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